結城さんはプロジェクトの作業ディレクトリに作業ログを置くという方法。

[結] 作業ログを書くために大切な、たった一つのこと - 結城浩の日記
http://www.hyuki.com/d/200605.html#i20060531075544

私の場合は、プロジェクトに関する情報（例えばディレクトリ名、データ
置場、実行したコマンド with 引数、TODOや問題点など）を
一つの ChangeLog ファイルにどんどん貼り付けています（いわゆる
「ChangeLogメモ」です）。
ChangeLog ファイルが全プロジェクトの共通の作業ログです。
プロジェクトごとに作業ログを分けることはしてません。

プロジェクト名がうろ覚えでも、コマンド名やディレクトリ名や使った
データファイル名や打合せに出席した人の名前なんかを覚えていれば、
さくっと検索できるという利点もあります。

まあ、最近はデスクトップ検索を使う人が多いので、必ずしも1ファイル
に集約しなくても良いかもしれませんね。